客串作者:Jennifer Gardy博士
BC省疾病控制中心高级科学家;英属哥伦比亚大学人口与公共卫生学院助理教授
流感似乎不知道从哪里冒出来的。前一分钟你还感觉棒极了，几小时后你就会感到发烧、疼痛、疲倦和极度痛苦。这是一种不可预测的感染，发作迅速，没有任何征兆。在全球范围内，这种不可预测性也同样存在，尤其是在季节性流感疫苗的研制过程中。
季节性流感疫苗包含三种成分:一种H3N2流感病毒株，一种H1N1流感病毒株和一种b型流感病毒株，它们应该可以预防流感季节流行的大多数流感病毒。然而，必须在流感季节之前就决定将哪三种毒株包括在疫苗中，所以我们不是等着看哪些毒株在传播，而是对6到8个月后哪些毒株可能在我们的社区传播进行有根据的猜测。
你可以想象，有时候这些预测是不正确的。我们可能对三种成分中的两种预测正确，但有一种是错误的â€-这种情况经常发生在H3N2病毒上，与H1N1或B型流感病毒相比，H3N2病毒突变很快。或者，我们可能会对一种从未见过的全新流感病毒感到惊讶，就像2009年猪源H1N1流感大流行那样。
当疫苗中的流感病毒株与人群中流行的流感病毒株不匹配时，我们称之为甲型流感不匹配．不匹配导致减少疫苗的有效性因此，有些人即使接种了季节性流感疫苗，仍会感染流感。在不匹配的情况下，疫苗的有效性可能从通常的70%下降到低至20-30%——仍然有一些保护作用，但没有我们希望看到的那么多。
的流感就在你身边网页追踪北美的流感病例。在这里，我们放大波士顿，这是FNY的总部，因此有最大的可用数据。
所以，在我们发明一个无所不知、无所不知的水晶球之前，我们如何装备自己，对流感疫苗的成分做出最明智的决定呢?数据!
开放获取数据正在改变公共卫生的运作方式。从网站HealthMap.org通过扫描基于网络的资源来跟踪疾病爆发活动，并向任何有互联网连接的人提供信息，向研究小组提供免费在线数据并邀请世界各地的人参与他们的分析，数据共享正在帮助研究人员比以往更快地检查和准确了解健康状况。
对于流感来说尤其如此。几年前，流感研究界开始公开分享来自流感病毒遗传物质测序的数据。通过网站GISAID和NCBI流感病毒资源在美国，任何人都可以在全球实验室网络中获得正在分析的流感病毒的基因序列。
这些基因序列为我们提供了一个实时了解病毒进化的窗口，并帮助我们选择季节性流感疫苗的成分。我们可能会看到一种特定的毒株正在出现，并将主导即将到来的流感季节，这表明它应该包括在疫苗中。或者，我们可能会看到像H1N1这样的病毒没有发生太多的突变，所以自五年前推出疫苗以来，我们没有改变疫苗的组成部分。
我们还可能会看到一种新出现的病毒，它不同于最新的疫苗毒株，这可能会导致我们改变下一季疫苗中包含的毒株。例如，今年用于北半球的疫苗使用了上一季的H3N2毒株，但为南半球(他们的流感季节发生在7月左右，这是他们的冬季)制作的疫苗包括了一种新的毒株，因为遗传数据表明一种新型的H3N2病毒正在出现。这种新毒株似乎在这个季节甚至在北半球也占主导地位，这意味着今年季节性流感疫苗的H3N2成分显示出效力下降。
数据共享也有助于迅速了解全新类型的流感。2009年，当新型猪源H1N1病毒出现并引起大流行时，每天都从世界各地收集的病毒中生成基因序列，并将其存入公共存储库。安德鲁·兰姆伯特他创建了一个维基页面，来自世界各地的流感专家通过该页面贡献了他们对现有序列的分析。利用这种合作的“开放式实验室笔记本”，该团队能够在爆发早期计算出病毒的几个重要特征，包括它传播的速度有多快，现有的流感病毒重组成新的大流行病毒，以及重组可能发生的时间。
短短几年后，当新的猪源H3N2病毒开始出现在参观过美国中西部农业博览会的人群中时，同样的遗传数据分析被用于迅速确定新病毒对成人人群几乎没有大流行风险，尽管疫苗的生产是作为预防措施进行的。
随着新的流感病毒不断出现，实时基因分析将帮助我们了解和应对这些新的威胁。对其他病原体的类似分析将帮助我们了解公共卫生雷达上的其他新出现的传染病。基于维基百科的众包分析已经帮助解开了一种新的大肠杆菌这导致了2011年在德国的大规模爆发。研究人员最近公布了来自西非正在爆发的埃博拉病毒的基因序列数据，希望有助于加快对疫情及其动态的了解。
21世纪的公共卫生圣Century将从根本上依赖数据。研究人员和卫生机构可以通过使尽可能多的数据免费获取，通过鼓励通过社交媒体和维基页面共享信息，以及通过促进快速周转和开放获取的出版来分享他们的成果，从而为新发现、新理解和新的合作精神打开大门。数据及其民主使用可能是我们抵御未来流行病的最佳防御。
